खानवा युद्ध के निम्नलिखित परिणाम हुए
1. भगत में राजपूतों की सर्वोच्चता का अन्त हो गया। राजपूतों का वह प्रताप – सूर्य जो भारत में गगन के उच्च स्थान पर पहुँच कर लोगों में चकाचौंध उत्पन्न कर रहा था, अब अस्ताचल की और खिसकने लगा था।
2. मेवाड़ की प्रतिष्ठा और शक्ति के कारण निर्मित राजपूत संगठन इस पराजय के साथ ही समाप्त हो गया।
3. भारतवर्ष में मुगल साम्प्रज्य स्थापित हो गया और बाबर स्थिर रूप से भारत का बादशाह बन गया।